标签：分子动力学

基于GROMACS 2025.4的分子动力学模拟服务器，提供TPR文件分析、模拟工作流执行、批量分析等功能，适用于生物分子和化学系统研究。

一个MCP服务器，使AI助手能够与LAMMPS（大规模原子/分子并行模拟器）交互，进行分子动力学模拟。

提供基于AMBER套件的分子动力学模拟和PDB结构松弛功能，支持AI助手进行蛋白质结构分析和能量最小化。

OpenMM MCP Server是一个用于分子动力学模拟和密度泛函理论计算的综合服务器，提供自然语言接口和高级采样方法。

一个基于ASE、pymatgen和现代机器学习原子间势能的FastMCP服务器，为原子建模工作流提供结构构建、几何优化、分子动力学模拟和结构分析等功能。

基于Docker的AmberTools25/Amber24分子动力学模拟和分析服务，提供蛋白质PDB结构的全MD模拟功能。